一、 實驗原理
繼分析DNA的Southern雜交方法出現后,1977年Alwine等人提出一種與此相類似的、用于分析細胞總RNA或含poly A尾的RNA樣品中特定mRNA分子大小和豐度的分子雜交技術,這就是與Southern相對應而定名的Northern雜交技術。這一技術自出現以來,已得到廣泛應用,成為分析mRNA最為常用的經典方法。
與Southern雜交相似,Northern雜交也采用瓊脂糖凝膠電泳,將分子量大小不同的RNA分離開來,隨后將其原位轉移至固相支持物(如尼龍膜、硝酸纖維膜等)上,再用放射性(或非放射性)標記的DNA或RNA探針,依據其同源性進行雜交,最后進行放射自顯影(或化學顯影),以目標RNA所在位置表示其分子量的大小,而其顯影強度則可提示目標RNA在所測樣品中的相對含量(即目標RNA的豐度)。但與Soughern雜交不同的是,總RNA不需要進行酶切,即是以各個RNA分子的形式存在,可直接應用于電泳;此外,由于堿性溶液可使RNA水解,因此不進行堿變性,而是采用甲醛等進行變性電泳。雖然Northern也可檢測目標mRNA分子的大小,但更多的是用于檢測目的基因在組織細胞中有無表達及表達的水平如何。
二、應用簡介
1、定性及定量分析基因轉錄水平差異;
2、檢測目的基因是否具有可變剪切產物或者重復序列。
三、 實驗方法
四、樣本送檢要求
五、案例展示
六、常見問題
1.為了抑制RNA酶的活性,所有用于Northern印跡的溶液,均須用經DEPC處理過的無菌去離子水配制。DEPC是一種致癌劑,須小心操作。尤其在用DEPC處理乙酸銨時,因為DEPC能與銨離子反應產生氨基甲酸乙酯(一種潛在的致癌劑),故在以DEPC處理乙酸銨時,更須分外小心。
2.RNA極易被環境中存在的RNA酶降解,因此須特別警惕RNA酶的污染。操作時必須仔細、小心,嚴格按同位素操作規程進行,以防止同位素污染。
3. 必要時,可采用Sephades G-50柱層析法純化標記的探針,以去除標記反應中未結合的(游離的)核苷酸。
3. 膜的重復使用:結合了待測RNA的膜與探針雜交后,可經堿或熱變性方法將探針洗脫,膜可反復使用與其它探針雜交。方法如下:雜交的膜(注意:雜交過的膜在保存過程中不能干燥,否則探針將會與膜形成不可逆的結合)置100℃ 0.5% SDS中煮沸3min,自然冷卻至室溫后,將膜放入雙蒸水中漂洗2-3遍。取出膜,用濾紙吸去膜表面的水份。將膜直接進行另一種探針的雜交或用保鮮膜包好,室溫下真空保存。
七、服務流程
病理學檢測
分子生物學檢測
免疫學檢測服務
細胞實驗服務
動物實驗平臺